Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HP1BP3Q5SSJ5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HP1BP3Q5SSJ5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms