Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC27A3Q5K4L6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms