Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITRM1Q5JRX3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms