Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPIN4Q56A73 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIN4Q56A73 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIN4Q56A73 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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