Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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