Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KIR2DP1-201ENST00000415311 1331 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 DHDDS-201ENST00000236342 1403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC89-201ENST00000316398 1412 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC130710.1-201ENST00000412381 642 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 U2AF1L4-203ENST00000412391 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL031727.2-201ENST00000416470 207 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC114489.1-201ENST00000421619 395 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AP001630.1-201ENST00000428410 437 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ACOT9-207ENST00000492081 683 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC58-206ENST00000497726 438 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN20-222ENST00000509774 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN20-226ENST00000513156 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC209005.1-201ENST00000514043 464 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms