Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms