Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHKAPQ2M3C7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms