Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms