Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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CDO1Q16878 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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