Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms