Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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