Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZIC1Q15915 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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