Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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SCN9AQ15858 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SCN9AQ15858 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SCN9AQ15858 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SCN9AQ15858 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SCN9AQ15858 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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