Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms