Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms