Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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SMCO1Q147U7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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SMCO1Q147U7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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SMCO1Q147U7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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SMCO1Q147U7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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