Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms