Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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