Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE3AQ14432 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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