Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CKAP5Q14008 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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