Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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