Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms