Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPA4Q13156 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPA4Q13156 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPA4Q13156 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPA4Q13156 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPA4Q13156 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RPA4Q13156 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RPA4Q13156 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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