Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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CHAF1BQ13112 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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