Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms