Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms