Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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