Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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