Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms