Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms