Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LRP1Q07954 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms