Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms