Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms