Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms