Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms