Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms