Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms