Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms