Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms