Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PITPNAQ00169 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms