Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms