Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms