Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPAP53621 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms