Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms