Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOSBP53539 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms