Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGSHP51688 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGSHP51688 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGSHP51688 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGSHP51688 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms