Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK8P49336 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK8P49336 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms