Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NESP48681 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NESP48681 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NESP48681 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NESP48681 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NESP48681 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NESP48681 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms