Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms